Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RYR3Q15413 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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