Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 27.8
PCBP2Q15366 ZMIZ2-209ENST00000463931 861 ntTSL 413.83□□□□□ -0.21e-8■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 AAMP-205ENST00000447885 671 ntTSL 512.34□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 ZMIZ2-212ENST00000482322 724 ntTSL 211.14□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 CHN2-204ENST00000409922 740 ntTSL 28.84□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 JMJD1C-211ENST00000633035 499 ntTSL 315.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.517e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.074e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 APLP1-208ENST00000590561 2295 ntTSL 219.34■□□□□ 0.697e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.014e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 APLP1-204ENST00000587274 1179 ntTSL 514.69□□□□□ -0.067e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.234e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 UBL7-207ENST00000565494 458 ntTSL 211.73□□□□□ -0.534e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.584e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 UBL7-204ENST00000564488 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.64e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 UBL7-208ENST00000566365 661 ntTSL 310.26□□□□□ -0.774e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 APLP1-210ENST00000591165 463 ntTSL 26.51□□□□□ -1.377e-10■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TNFRSF12A-203ENST00000571351 1678 ntTSL 219.94■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TNFRSF12A-205ENST00000574699 583 ntTSL 218.08■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 ANKRD17-210ENST00000561029 2717 ntTSL 521.22■□□□□ 0.999e-8■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.59e-8■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.487e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.967e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TSPAN3-208ENST00000560514 638 ntTSL 216.51■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TSPAN3-204ENST00000558394 550 ntTSL 416.51■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.542e-14■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.62e-14■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.612e-14■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-14■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.276e-8■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.446e-8■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-226ENST00000450424 2658 ntTSL 517.75■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-208ENST00000413967 2808 ntTSL 216.6■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-210ENST00000421110 2755 ntTSL 516.35■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-213ENST00000426123 2907 ntTSL 214.78□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 EIF4G1-223ENST00000444134 558 ntTSL 510.4□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 RPL37A-207ENST00000478153 2082 ntTSL 1 (best)21.22■□□□□ 0.998e-24■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 RPL37A-201ENST00000359681 742 ntTSL 1 (best)16.77■□□□□ 0.288e-24■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 RPL37A-202ENST00000420712 385 ntTSL 59.23□□□□□ -0.938e-24■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 RPL37A-208ENST00000487233 2225 ntTSL 28.78□□□□□ -18e-24■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 RPL37A-209ENST00000490649 1701 ntTSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.128e-24■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.238e-24■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 WBP2-208ENST00000588373 1374 ntTSL 214.43□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 ARHGAP19-206ENST00000492211 5525 ntTSL 28.06□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 ARHGAP19-205ENST00000487035 4553 ntTSL 26.81□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 TULP4-207ENST00000620026 680 ntTSL 419.84■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.679e-8■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.359e-8■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.359e-8■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.359e-8■■■■■ 27.7
PCBP2Q15366 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.723e-6■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 INPP5A-204ENST00000423490 416 ntTSL 55.64□□□□□ -1.513e-6■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 TMEM184B-205ENST00000436674 3667 ntTSL 1 (best)12.87□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 TMEM184B-201ENST00000361684 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.756e-13■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.069e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.119e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.879e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 FAM172A-205ENST00000506398 965 ntTSL 58.96□□□□□ -0.989e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 FAM172A-202ENST00000502503 1392 ntTSL 28.95□□□□□ -0.989e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.226e-13■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.486e-13■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 FAM172A-203ENST00000504768 803 ntTSL 54.98□□□□□ -1.619e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.359e-22■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 FAM122B-206ENST00000486347 1381 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.029e-22■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 PARD3-211ENST00000466092 806 ntTSL 57.96□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 547 ntTSL 511.85□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC7.43□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 27.6
PCBP2Q15366 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 216.95■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 27.6
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