Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF1Q15361 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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