Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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