Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NCAPD2Q15021 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCAPD2Q15021 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms