Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALCAMQ13740 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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