Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD2Q13563 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD2Q13563 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD2Q13563 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKD2Q13563 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD2Q13563 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
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