Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SCGB2A2Q13296 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB2A2Q13296 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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