Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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