Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA3BQ13214 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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