Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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RPA4Q13156 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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RPA4Q13156 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RPA4Q13156 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms