Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RESTQ13127 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RESTQ13127 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RESTQ13127 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RESTQ13127 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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