Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP4Q13115 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms