Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHAF1AQ13111 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHAF1AQ13111 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms