Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRDNQ13061 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRDNQ13061 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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