Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRJQ12913 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRJQ12913 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRJQ12913 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRJQ12913 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRJQ12913 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRJQ12913 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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