Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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