Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCAPQ12770 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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