Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PUDPQ08623 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms