Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms