Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCN1BQ07699 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms