Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK18Q07002 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms