Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN11Q06124 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms