Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP1Q04837 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms