Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4A11Q02928 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms