Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLOD1Q02809 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms