Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP27A1Q02318 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms