Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHDQ02161 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHDQ02161 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RHDQ02161 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHDQ02161 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHDQ02161 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms