Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms