Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN7AQ01118 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms