Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

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Length 54 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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