Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2BQ00403 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2BQ00403 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms