Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNB1P98172 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms