Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB1P82279 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB1P82279 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB1P82279 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB1P82279 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB1P82279 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRB1P82279 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CRB1P82279 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRB1P82279 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRB1P82279 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRB1P82279 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRB1P82279 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRB1P82279 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms