Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms