Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms