Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB1AP62820 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB1AP62820 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms