Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms