Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NCS1P62166 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCS1P62166 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCS1P62166 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCS1P62166 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCS1P62166 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCS1P62166 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms