Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VBP1P61758 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VBP1P61758 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms