Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB5BP61020 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB5BP61020 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB5BP61020 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB5BP61020 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5BP61020 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5BP61020 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5BP61020 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB5BP61020 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RAB5BP61020 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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