Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFRD-1P60508 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms