Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP107P57740 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms