Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms