Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGGT1BP53609 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGGT1BP53609 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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