Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LUMP51884 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LUMP51884 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms