Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCT4P50991 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCT4P50991 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCT4P50991 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCT4P50991 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCT4P50991 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT4P50991 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT4P50991 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms