Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBP2P50120 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms