Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTPAP49638 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTPAP49638 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTPAP49638 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms