Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK8P49336 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK8P49336 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK8P49336 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK8P49336 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK8P49336 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms